iTunes ファイルを移動出来たのですが、iTunes のライブラリにあるアプリケーションをクリックすると今までは、iPhone アプリのアイコンがずらっと並んでいたのですが全く何も表示されていません。

iTunes の環境設定を見てもそれらしき設定も見あたりません、元々の場所（ユーザー/ミュージック/Mobile Applications/）にはダウンロードしたアプリがあります。

表示されないだけか、購入したアプリとして認識されていないのか無料アプリを購入してみる事にしました。

認識していれば、既に購入済みとなるはずですが、何も表示されませんと言う事で、iTunes に読み込まなくてはなりません。

色々悩んだ末に、「ユーザー/ミュージック/Mobile Applications/」に在るアプリを右クリックし「このアプリケーションで開く・・・」を見ると iTunes になっていたので駄目元で選択するとライブラリにあるアプリケーションにアプリのアイコンが表示されるようになりました。

残りのアプリ全てを選択し「 iTunes で開く」事を選択する事によって全てを取り込む事が出来るようになりました。